Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 PHEX-AS1-201ENST00000424650 1906 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 GATAD2B-204ENST00000634544 2342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 GARNL3-205ENST00000435213 3599 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
ERVV-2B6SEH9 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
ERVV-2B6SEH9 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms