Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00312Q9Y6C7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms