Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXBP1Q9Y5B6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms