Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SBNO2Q9Y2G9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SBNO2Q9Y2G9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms