Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DTX4Q9Y2E6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DTX4Q9Y2E6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms