Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS5Q9UPZ3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS5Q9UPZ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms