Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KIAA1024Q9UPX6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KIAA1024Q9UPX6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms