Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNPO2Q9UMS6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNPO2Q9UMS6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms