Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CIZ1Q9ULV3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms