Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
PARP4Q9UKK3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PARP4Q9UKK3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms