Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMPXQ9UHP9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMPXQ9UHP9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms