Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO40Q9UH90 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms