Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCDH10Q9P2E7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCDH10Q9P2E7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms