Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNRD1Q9P1U0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNRD1Q9P1U0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms