Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCHIP1Q9P0W5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms