Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SH3BP4Q9P0V3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SH3BP4Q9P0V3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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SH3BP4Q9P0V3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SH3BP4Q9P0V3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SH3BP4Q9P0V3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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SH3BP4Q9P0V3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SH3BP4Q9P0V3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
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