Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GDE1Q9NZC3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GDE1Q9NZC3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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