Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GGA3Q9NZ52 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GGA3Q9NZ52 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms