Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIS18AQ9NYP9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIS18AQ9NYP9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
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