Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KLHL28Q9NXS3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KLHL28Q9NXS3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms