Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BSDC1Q9NW68 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BSDC1Q9NW68 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms