Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR3EQ9NVU0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR3EQ9NVU0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms