Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMC4Q9NTJ3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMC4Q9NTJ3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms