Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PDS5BQ9NTI5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
PDS5BQ9NTI5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms