Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP7BPQ9NSQ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP7BPQ9NSQ0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms