Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOMER2Q9NSB8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms