Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
KCNIP2Q9NS61 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms