Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
RAB6BQ9NRW1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RAB6BQ9NRW1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms