Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
A4GALTQ9NPC4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
A4GALTQ9NPC4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms