Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVK-5Q9HDB9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms