Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPJQ9HC77 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPJQ9HC77 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms