Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ELL3Q9HB65 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms