Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SENP6Q9GZR1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SENP6Q9GZR1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SENP6Q9GZR1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SENP6Q9GZR1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP6Q9GZR1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SENP6Q9GZR1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms