Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
NLRP1Q9C000 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NLRP1Q9C000 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms