Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ROPN1BQ9BZX4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ROPN1BQ9BZX4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms