Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-3Q9BYQ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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