Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW66

CINP, Cyclin-dependent kinase 2-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CINPQ9BW66 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CINPQ9BW66 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CINPQ9BW66 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms