Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC115102.1-201ENST00000558044 487 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 LINC01571-201ENST00000563603 811 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PHF23Q9BUL5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms