Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TXNDC17Q9BRA2 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms