Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF559Q9BR84 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF559Q9BR84 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms