Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
FYCO1Q9BQS8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
FYCO1Q9BQS8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FYCO1Q9BQS8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms