Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SGIP1Q9BQI5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SGIP1Q9BQI5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms