Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYD88Q99836 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYD88Q99836 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms