Protein–RNA interactions for Protein: Q99603

TRGV9, T-cell receptor gamma variable 9 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGV9Q99603 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRGV9Q99603 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms