Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC85AQ96PX6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85AQ96PX6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms