Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNDC3BQ96NL0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms