Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM20AQ96MK3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM20AQ96MK3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms