Protein–RNA interactions for Protein: Q96M95

CCDC42, Coiled-coil domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42Q96M95 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC42Q96M95 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC42Q96M95 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms