Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL15Q96M94 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms