Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SAMD8Q96LT4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SAMD8Q96LT4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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